Stepping down the evolutionary stairway of feeding cell induction by plant parasitic nematodes with spatial transcriptomics at near-cellular level to design resistant crops

    Project: NWO project

    Project Details

    Description

    Plant-parasitic nematodes are considered the most rapidly spreading plant pathogens in agriculture and pose an increasing threat to global food security. Cryo-sectioning will be combined with next generation mRNA sequencing (RNA tomography) to identify key evolutionary transitions that have led to the development of the extravagant and complex feeding cells induced by root-knot and cyst nematodes, their sole food source. Evolutionary transitions will be identified by a comparative analysis of basal and sister lineages within different clades of the phylum Nematoda. Blocking these key transitions by targeted mutagenesis will open new avenues to design cultivars with novel resistances.

    Description

    Plantenparasitaire nematoden veroorzaken wereldwijd in toenemende mate schade aan landbouwgewassen, onder meer door schaarste aan geschikte resistenties. In dit project zullen microscopische coupes van voedingscellen geïnduceerd door wortelknobbelaaltjes en cystenaaltjes, hun enige voedselbron, geanalyseerd worden met behulp van ultragevoelige mRNA sequentie technieken. Door verschillende typen voedingscellen, variërend van primitieve tot geavanceerde vormen, binnen het phylum Nematoda te vergelijken kunnen essentiële evolutionaire stadia geïdentificeerd worden die geleid hebben tot het ontstaan van de geavanceerde voedingscelcomplexen van wortelknobbelaaltjes en cystenaaltjes. Kennis van de DNA-sequenties die deze evolutionaire transities markeren zullen benut worden voor het ontwikkelen van nieuwe resistenties middels gecontroleerde mutagenese.
    StatusActive
    Effective start/end date6/03/24 → …

    Fingerprint

    Explore the research topics touched on by this project. These labels are generated based on the underlying awards/grants. Together they form a unique fingerprint.