Moleculaire evolutie van ESBLs en CP's (WOT-01-002-003.09)

Het project heeft betrekking op de evolutie van antibioticumresistentiegenen (ESBLs en CPs [carbapenemasen]).

Het doel van dit project is om breder naar de evolutie van gastheren en ESBLs te kunnen kijken om emerging organismen of genen en trends sneller te kunnen signaleren. Hiervoor zal een referentiedatabase worden gemaakt met daarin de bestaande collectie van beta-lactamase producerende isolaten binnen Wageningen Bioveterinary Research. Deze initieel genomics georiënteerde database zal zodanig worden gebouwd, dat deze de karakteristieken van het totale genoom van deze isolaten, dus zowel het ESBL/CP-gen als het complete genoom van de bacterie gastheer, zal bevatten. Hierdoor kan de mogelijke co-evolutie van het ESBL/CP-gen met de bacterie gastheer worden bestudeerd.  Door ook essentiële metadata (zoals herkomst, orgaansysteem, bron, datum etc.) op te nemen in deze database kan deze ook voor moleculair epidemiologische signalering van trends in ESB/CP toename gebruikt worden.