AF-16022 Breed4Food (BO-63-001-009, BO-47-001-021, BO-22.04-025-001, BO-22.04-011-001, BO-22.02-011-001)

Project: EZproject

Project Details

Description

Om genetische variatie te kunnen gebruiken voor de ontwikkeling van duurzame veehouderijsystemen zijn nieuwe fenotypering en selectie methoden nodig. Binnen Breed4food lopen dan ook verschillende projecten binnen deze twee pijlers: 1) fenotyperen en 2) gebruik DNA informatie.

Voor fenotyperings projecten werd een proef werd uitgevoerd door Hendrix Genetics op objectieve score van locomotie van kalkoenen met het gebruik van video-imaging, IMU's en een force plate. Een andere manier om gedrag, en activiteit van dieren die in groepen zijn ondergebracht te volgen, is onderzocht bij slachtkuikens, met ultrabrede banden en met RFID's. De gegevens toonden aan dat het mogelijk is om dieren gedurende een paar dagen te volgen en hun activiteit gedurende de dag te fenotyperen. Verschillen werden waargenomen tussen twee foklijnen. Longitudinale gegevens over melkgift en voeropname van kalkoenen zijn geanalyseerd in het gezondheidsproject, met als doel om afwijkingen te koppelen aan veerkracht van de dieren. De eerste resultaten laten zien dat er verschillen zijn tussen dieren en deze genetisch bepaald zijn. Om voederefficiëntie te kunnen onderzoeken wordt het gebruik van organoïds onderzocht. Hoewel aantallen klein waren, zijn er verschillen vastgesteld tussen organoïden van varkens die werden geselecteerd als hoog en laag efficiënt.

Bij het gebruik van DNA is er met name grote vooruitgang geboekt met de ontwikkeling van algoritmen en software voor genomische fokwaardeschaatings. Een test met een genomisch fokwaardeschattingsmodel met 1,2 miljoen gegenotypeerde dieren is met succes afgerond. Dit was wereldwijd baanbrekend. In termen van het gebruik van (aanvullende) bronnen van genomische informatie, wordt vooruitgang geboekt in karyotypering met sequentiegegevens, afleidende en kenmerken van CNVs, en een nieuw model waarmee genomische voorspelling voor kleine rassen gebruik kan maken van de gegevens van numeriek grotere rassen.

StatusActive
Effective start/end date1/01/1431/12/20

Research Output

Can greenhouse gases in breath be used to genetically improve feed efficiency of dairy cows?

Difford, G. F., Løvendahl, P., Veerkamp, R. F., Bovenhuis, H., Visker, M. H. P. W., Lassen, J. & de Haas, Y., Mar 2020, In : Journal of Dairy Science. 103, 3, p. 2442-2459

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access
  • Functional and population genetic features of copy number variations in two dairy cattle populations

    Lee, Y. L., Bosse, M., Mullaart, E., Groenen, M. A. M., Veerkamp, R. F. & Bouwman, A. C., 28 Jan 2020, In : BMC Genomics. 21, 1, 89.

    Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

    Open Access
  • Genetics of crossbreeding

    Duenk, P., 2020, Wageningen: Wageningen University. 189 p.

    Research output: Thesisinternal PhD, WU

    Open Access

    Activities

    • 36 Public lecture/debate/seminar
    • 26 Oral presentation

    Efficient algorithms for genomic analyses - SNP pruning in large genotype and sequence datasets

    Mario Calus (Speaker), Jeremie Vandenplas (Contributor)
    7 Jan 2020

    Activity: Talk or presentationOral presentation

    Benefit whole genome sequence information in animal breeding?

    Roel Veerkamp (Speaker)
    17 Oct 2019

    Activity: Talk or presentationPublic lecture/debate/seminar

    Who to genotype to improve crossbred performance: Purebreds or Crossbreds?

    Y.C.J. Wientjes (Speaker)
    9 May 2019

    Activity: Talk or presentationPublic lecture/debate/seminar

    Press / Media

    Fokkerij biedt perspectief bij verbeteren veerkracht

    H.W.M. Poppe, H.A. Mulder & T.V.L. Berghof

    15/03/19

    1 Media contribution

    Press/Media: Research

    Measuring methane emissions in cows’ breathing

    D. de Vries & Y. de Haas

    22/03/17

    1 Media contribution

    Press/Media: Expert Comment