Filter
Comment/Letter to the editor

Search results

  • 2025

    Discovery of metabolites prevails amid in-source fragmentation

    El Abiead, Y., Rutz, A., Zuffa, S., Amer, B., Xing, S., Brungs, C., Schmid, R., Correia, M. S. P., Caraballo-Rodriguez, A. M., Zarrinpar, A., Mannochio-Russo, H., Witting, M., Mohanty, I., Pluskal, T., Bittremieux, W., Knight, R., Patterson, A. D., van der Hooft, J. J. J., Böcker, S. & Dunn, W. B. & 6 others, Linington, R. G., Wishart, D. S., Wolfender, J. L., Fiehn, O., Zamboni, N. & Dorrestein, P. C., Mar 2025, In: Nature Metabolism. 7, 3, p. 435-437

    Research output: Contribution to journalComment/Letter to the editorAcademic

  • 2020

    Mass spectrometry searches using MASST

    Wang, M., Jarmusch, A. K., Vargas, F., Aksenov, A. A., Gauglitz, J. M., Weldon, K., Petras, D., da Silva, R., Quinn, R., Melnik, A. V., van der Hooft, J. J. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Nothias, L. F., Aceves, C. M., Panitchpakdi, M., Brown, E., Di Ottavio, F., Sikora, N., Elijah, E. O. & Labarta-Bajo, L. & 16 others, Gentry, E. C., Shalapour, S., Kyle, K. E., Puckett, S. P., Watrous, J. D., Carpenter, C. S., Bouslimani, A., Ernst, M., Swafford, A. D., Zúñiga, E. I., Balunas, M. J., Klassen, J. L., Loomba, R., Knight, R., Bandeira, N. & Dorrestein, P. C., 1 Jan 2020, In: Nature Biotechnology. 38, p. 23-26

    Research output: Contribution to journalComment/Letter to the editorAcademicpeer-review

    Open Access
    172 Citations (Scopus)
  • 2019

    Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N. A., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Chase, J. & Cope, E. K. & 92 others, Da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Kang, K. B., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y. X., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., van der Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vázquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 9 Aug 2019, In: Nature Biotechnology.

    Research output: Contribution to journalComment/Letter to the editorAcademic

    490 Citations (Scopus)
  • Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N. A., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, T. C., Callahan, B. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Chase, J. & Cope, E. K. & 92 others, da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Kang, K. B., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y. X., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., van der Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vázquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 1 Aug 2019, In: Nature Biotechnology. 37, 8, p. 852-857 6 p.

    Research output: Contribution to journalComment/Letter to the editorAcademicpeer-review

    14289 Citations (Scopus)